Hola xugus23:
El protocolo de transporte o transferencia de correo SMTP es de mayor velocidad; principalmente se encarga de transmitir correo entre servidores de correo, como característica importante es que no requiere autentificación, dicho protocolo se suele configurar de forma que sólo intervenga en el envío del correo que nosotros enviamos a otros usuarios.
El protocolo de acceso a correo POP se usa para la comunicación desde el servidor hacia el PC del usuario, requieren autenticación de los clientes usando un nombre de usuario y una contraseña, y tras ella se descargue el contenido completo de cada mensaje. Este protocolo mediante el cual se recibe el correo, se utiliza cuando la persona envía el correo recibido desde el servidor a nuestro ordenador. Esto puede tomar un buen tiempo si algún mensaje tiene anexos con un gran volumen.
Espero haberte ayudado
Un saludo