Hola.
La Ley 12/10 de igualdad entre Mujeres y Hombres, dice en su art. 15 lo siguiente:
Dependiente de la Consejería con competencias en materia de economía y hacienda se crea la Comisión de Igualdad, integrada paritariamente por representantes de la mencionada Consejería y el Instituto de la Mujer de Castilla-La Mancha.
En base a esto, debes de encuadrarla en la Consejería de vicepresidencia y economía y hacienda.
Un saludo