Hola Runa, fíjate en que el texto que hay en las dos columnas es un sólo párrafo, por lo tanto cuando cambias la alineación, de una columna se cambia todo el texto. Prueba y verás.
Escribe un sólo párrafo, luego lo conviertes en dos colunmas, después cambias la alineación de una columna: “centrada, justificada o lo que quieras” verás como se cambian las dos columnas.
Si no te sale, puede ser que tengas dos párrafos, mira a ver si has puesto algún punto y a parte en alguna línea.
Saludos.