Hola,
Si se cumplen esos requisitos (reunión de la Comisión Bilateral de Cooperación y acuerdo sobre el inicio de negociaciones para resolver el conflicto), y ese acuerdo se pone en conocimiento del Tribunal Constitucional, entonces el plazo para interponer el recurso de inconstitucionalidad sería de 9 meses en vez de tres.
Se supone que como han iniciado negociaciones para llegar a un acuerdo y así evitar la interposición del recurso, la idea es que puedan tener tiempo para ello, y ya si finalmente no se resuelve la discrepancia, interponer el recurso.
Yo lo entiendo así