Hola Villa!
Yo también pienso que son 10 porque aunque la Consejería de la Presidencia sea un órgano que se integre en la Presidencia de la Junta, sigue siendo una Consejería.
Además el Real Decreto 125/2008 de 31/08/2008 por el que se establece la estructura de la Administración Regional, en su artículo 1 dice: “La Administración Regional de Castilla La Mancha, se estructura en las siguientes Consejerías….” y enumera las 10, incluida la Consejería de la Presidencia, así que si en el Decreto aparece incluida creo que no hay lugar a duda.
Un saludito!