Hola,
Lo que se dice ahí sobre los plazos viene a coincidir con la forma en que se computan los plazos en general en las leyes procesales, si miras el artículo 133 de la LEC dice lo mismo.
Al decir que si el plazo se señala por días se realizará por días hábiles quiere decir que no se tienen en cuenta los sábados, domingos y festivos, por lo que si se dice por ejemplo que el plazo será de diez días, vamos a suponer que se señala hoy, se empieza a computar a partir de mañana, y finalizaría el 6 de julio. Si en cambio en vez de ser 10 días hábiles fueran 10 días naturales, sí contarían sábados, domingos y festivos, y terminaría el día 2 de julio.
